Con D.P.R. 8 maggio 1992 n.329 l'Ufficio Circondariale Marittimo di Termoli è stato elevato a Capitaneria di Porto, assumendo la denominazione di "Capitaneria di Porto di Termoli".
Con D.P.R. 1 marzo 2005 n.51 è stata modificata la circoscrizione territoriale del Compartimento marittimo di Termoli includendo le Isole Tremiti.
